药学院面向医药产业，大力培养技术技能型人才，形成了普通专科、短期培训及校企合作办学等多层次多形式的药学类专业人才培养方式，打造了由中药学、药学、药物制剂技术、中药制药技术、药品质量与安全、药品经营与管理、制药设备应用技术、中药生产与加工等8个专业构成的覆盖整个药品（含中药）产业链的专业构架体系。其中，普通专科层次的中药学专业为国家"双高计划"建设核心专业、国家优质校建设重点专业、国家骨干专业以及教育部现代学徒制试点专业，药物制剂技术专业为中央财政支持高等职业学校提升专业服务产业发展能力项目的重点建设专业，药品质量与安全为央财支持实验室建设重点专业。同时中药学、药学、药物制剂技术、中药制药技术等专业还是重庆市市级骨干专业。

药学院师资力量雄厚，教师教学经验丰富。拥有全国优秀教师1人，重庆市教学名师1人、重庆市职业教育名师1人，教授7人，副教授5人，博士硕士41人，执业药师10人。获重庆市及区级科技进步奖6项，获省级科技成果3项，有市级教学团队1个，国家级精品在线开放课程1门，市级各类精品课程3门；同时还是重庆市科技特派员创业服务先进团队和万州区生态涵养发展建设重点创新团队。在长期办学实践中，药学院教学水平和人才培养质量在全国具有较好的声誉，中药教学团队为重庆市市级教学团队，在全国职业院校技能大赛中，中药学专业多名同学连续多年勇夺全国中药传统技能大赛的一、二等奖，获得免试升本的机会。

药学院教学条件优越，拥有国家与省级财政支持的职业教育实训基地各1个，与太极集团合作建设有药品经营生产性实训基地1个，拥有的全国首家大型中药科技馆是重庆市科普教育基地，药学院校内实训中心面积达5000m2,拥有1100多台套设备，设备总值达1000余万元。药学院长期注重校企合作，拥有国药控股、广州医药集团、太极集团、扬子江药业集团、云南健之佳连锁健康药房有限公司、鸿翔一心堂药业、希尔安药业等众多校外实践教学暨就业基地，长期办有 “健之佳班”、“一心堂班”“希尔安班”等多个形式灵活、种类多样、选择丰富的订单班，学生可根据自身实际情况自愿参加订单培养及顶岗带薪实习，就业率长期保持在100%。